南通大学艺术学院音乐系创办于1980年，位于通大钟秀校区。2011年获得音乐与舞蹈学一级学科硕士学位授予权。2019年3月南通大学与意大利锡耶纳“R.弗朗齐”音乐学院合作举办的音乐表演专业本科教育项目获教育部审批立项。现有毕业于上海音乐学院、中国音乐学院、沈阳音乐学院、南京艺术学院、华东师范大学等国内知名高校的师资团队39人，其中教授5人，副教授19人，博士7人，其中包括南通大学教学名师、南通市第四期“226高层次人才培养工程”第三层次培养对象、江苏省第五期“333高层次人才培养工程”第三层次培养对象、南通市宣传文化系统。2014年度“宣传文化人才千人计划”人才等优秀教学科研骨干教师。音乐学拥有包括声乐、钢琴、器乐、理论等教学科研团队，为学生专业素质、创新能力以及实践职业能力的培养奠定了基础。近5年来承担各级教学科研项目24项，其中省级项目6项，横向项目4项；发表专业论文92篇，其中 CSSCI 论文 32 篇，北大核心论文 36 篇；编辑出版专著、教材5部；获国家级、省级各类奖项50余项；本专业教师受邀赴美国、意大利、法国、英国参加音乐会及国际学术会议9场，赴上海音乐厅、宁波大剧院、南艺音乐厅、扬州音乐厅等参加音乐会演出数十场。

艺术学院音乐系现有音乐学（师范）、音乐表演、音乐表演中外合作办学三个专业。

音乐学（师范）专业创办于1980年，在20年培养函授及专科层次中学音乐教师的基础上，2001年开始培养本科层次的中学音乐教师，迄今已有37年专业办学历史。2011年获得音乐学一级学科硕士学位授权，招收音乐学学术硕士，2015年与南通大学教育科学学院联合培养音乐教育专业硕士，2016年获得专业硕士学位授权，设音乐教育方向，已培养了18名音乐教育专业硕士，在校音乐学学术硕士、专业硕士23人。本专业旨在培养德、智、体、美全面发展，系统掌握音乐教育的基本理论，基本知识、基本技能，具有创新精神、实践能力和良好的文化素养，能从事中、小学音乐教学和指导课外艺术活动，具有音乐教育研究能力的高素质技能型的音乐教育工作者。

音乐表演专业旨在培养德、智、体、美全面发展，基础扎实、知识面广，系统地掌握音乐表演专业基础知识和技能，有较强的审美能力和文化素养，同时具有一定的跨文化交流能力和实践能力，从事各类文艺团体的演员、社区音乐文化、文化馆站、音乐培训机构、音乐编辑和企业文化组织筹划等方面的音乐工作者。

音乐表演合作办学专业是本学院与意大利锡耶纳R.弗朗齐音乐学院合作举办的音乐表演专业本科教育项目，采用国际化的教学体系和“3＋1”中意分段教学的培养模式。学生前3年在南通大学艺术学院学习，其中三分之一的专业课程由意方教师讲授，如获得前3年在通大的规定学分，意大利语成绩达到CILS B1等级，并通过专业水平测试，后1年可在意大利锡耶纳“R.弗朗齐”音乐学院学习。学生完成全部学业后可获得南通大学颁发的本科毕业证书，符合学士学位授予条件的可获得分别由南通大学和“R.弗朗齐”音乐学院授予的学士学位。本专业旨在培养德、智、体、美全面发展，系统地掌握音乐表演专业基础知识和技能，具有一定的音乐审美能力与音乐实践能力,具有较高的文化素养和较强的艺术表现能力和综合实践能力，同时具备一定的外语写作能力和外语沟通能力，熟悉中西文化，具有国际视野和跨文化沟通能力的音乐表演领域高层次人才。